Vorlesung mit Übung: Strukturelle Bioinformatik

Bachelorstudiengang Bioinformatik, Modul Bioinf-15, 6 CP

Literaturempfehlungen 

Berg, Tymoczko, Stryer, "Biochemistry", Freeman & Company, New York

Branden & Tooze, "Introduction to Protein Structure", Garland Publishing, Inc., New York

Anmeldung

Die Anmeldung erfolgt persönlich in der ersten Lehrveranstaltung.

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Vorlesung

Vorlesungsunterlagen

StruBI 23/24

Die ersten vier Vorlesungen finden mittwochs von 14:00 bis 15:30 im H 15 im Hörsaalgebäude auf dem Campus Bockenheim statt. Geprüft wird mündlich am Ende der Vorlesungszeit. Die Termine werden mindestens vier Wochen vorher bekannt gegeben.

  Termine   Themen   Unterlagen
  18.10.2023  Proteinstruktur  protein_structure.pdf
  25.10.2023  Proteinstrukturtopologie  protein_topolgy.pdf
  01.11.2023

 Kompatibilitätsgraph

 Übungen

  protein_comparison.pdf
  08.11.2023

 paarweiser Proteinstrukturvergleich mit Bron/Kerbosch

 Übungen

 protein_comparison.pdf

 14_OP_p575_BronKerbosch.pdf

 FundamentalStudy01.pdf

Klausurtermin

Dienstag, den 20.02.2024 um 12:00-14:00 im Hörsaal 15 auf dem Campus Bockenheim

 

Prüfungsthemen

  1. Proteinstruktur
  2. Proteingraph
  3. Bron/Kerbosch
  4. NMR Grundlagen + 1D-Auswertung
  5. NMR-2D-Experimente und Anwendungen
  6. Strukturdynamiken mittels NMR
  7. Thermodynamische RNA-Strukturvorhersage
  8. Vergleichende RNA-Faltung (Comparative Folding)
  9. Experimentelle Strukturanalysen (Structure Probing)