Die gezielte Veränderung der Genfunktion ist ein leistungsfähiges Verfahren zur Untersuchung der Zusammenhänge zwischen Genotyp und Phänotyp. Genomweite und maßgeschneiderte CRISPR-Cas9-gRNAs und entsprechende Bibliotheken werden eingesetzt, um essenzielle und signalwegspezifische Gene zu identifizieren. Diese Plattform stellt mithilfe der 3Cs-Technologie projektspezifische Reagenzien und Bibliotheken her.
Die quantitative phänotypische Charakterisierung von Genen und Sequenzen ermöglicht die Identifizierung von i) einzelnen essenziellen Genen und synergistischen Geninteraktionen sowie ii) neuen Signalwegen und Komponenten komplexer biologischer Systeme.
Technische Spezifikationen
Herstellung von CRISPR-Cas9-gRNA-Bibliotheken
- Zusammenstellung der Zielgenliste
- Design von 2–6 gRNAs pro Gen
- Klonierung mittels 3Cs-Technologie in lentivirale, retrovirale oder AAV-Vektoren
- Bereitstellung als DNA, Viruspartikel oder transduzierte Zellen
Verfügbare Formate für genetische Screens
- Drop-out-Screening
- Anreicherungs-Screening
- Screening auf synergistische oder sensibilisierende Wirkstoffeffekte
- Biochemische Reporter/FACS-basierte Anreicherung oder Depletion
Verantwortlich: Prof. Manuel Kaulich und Dr. Koraljka Husnjak