Vorlesung mit Übung: Strukturelle Bioinformatik
Bachelorstudiengang Bioinformatik, Modul Bioinf-15, 6 CP
Literaturempfehlungen
Berg, Tymoczko, Stryer, "Biochemistry", Freeman & Company, New York
Branden & Tooze, "Introduction to Protein Structure", Garland Publishing, Inc., New York
Anmeldung
Die Anmeldung erfolgt persönlich in der ersten Lehrveranstaltung.
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Vorlesung
StruBI 23/24
Die ersten vier Vorlesungen finden mittwochs von 14:00 bis 15:30 im H 15 im Hörsaalgebäude auf dem Campus Bockenheim statt. Geprüft wird mündlich am Ende der Vorlesungszeit. Die Termine werden mindestens vier Wochen vorher bekannt gegeben.
Termine | Themen | Unterlagen |
18.10.2023 | Proteinstruktur | protein_structure.pdf |
25.10.2023 | Proteinstrukturtopologie | protein_topolgy.pdf |
01.11.2023 |
Kompatibilitätsgraph Übungen |
protein_comparison.pdf |
08.11.2023 |
paarweiser Proteinstrukturvergleich mit Bron/Kerbosch Übungen |
protein_comparison.pdf 14_OP_p575_BronKerbosch.pdf FundamentalStudy01.pdf |
Klausurtermin
Dienstag, den 20.02.2024 um 12:00-14:00 im Hörsaal 15 auf dem Campus Bockenheim
Prüfungsthemen
- Proteinstruktur
- Proteingraph
- Bron/Kerbosch
- NMR Grundlagen + 1D-Auswertung
- NMR-2D-Experimente und Anwendungen
- Strukturdynamiken mittels NMR
- Thermodynamische RNA-Strukturvorhersage
- Vergleichende RNA-Faltung (Comparative Folding)
- Experimentelle Strukturanalysen (Structure Probing)